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基于BP神经网络的大麦净光合速率预测

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  摘 要 净光合速率是植物重要的生理指标之一。植物的净光合速率受到各种环境因素的影响。利用BP神经网络模型拟合了大麦净光合速率与环境二氧化碳浓度,光照强度、温度和水的模型,并将预测值和观测值进行比较。结果表明,大麦BP神经网络模型能较准确的计算出大麦不同环境因素下的净光合速率。这为BP神经网络模型在其他植物净光合速率研究中的应用提供了参考。
  关键词 大麦;净光合速率;预测;BP神经网络模型
  中图分类号:S512.3 文献标志码:B 文章编号:1673-890X(2016)06--02
  净光合速率(Pn)是评价植物生长状况的重要指标之一,因此净光合速率一直是植物生理研究的一个重点。影响Pn的主要因素有:环境二氧化碳浓度,光照强度、温度和水[1]。青稞作为青藏高原地区藏族人民的主要粮食作物和动物饲料,对当地经济和人民生产生活中发挥着重要的作用[2]。由于高原独特的自然地理条件,研究青稞的Pn对提高青稞的产量和提高藏族人民的生活水平有着重要的意义。目前,研究青稞的Pn与环境因素之间的关系主要集中在研究Pn与光照强度,Pn与水[3]等。系统地研究和预测Pn与环境二氧化碳浓度、光照强度、温度和水之间的报道较少。
  BP神经网络(Back Propagation neural network)是最重要的人工神经网络模型之一,广泛地应用于非线性系统的模式识别和预测方面有着广泛的应用。Li等人通过利用偏最小二乘回归与BP神经网络预测番茄的光合速率发现BP神经网络拟合的结果精确度高于偏最小二乘回归[4]。
  本研究主要目的是:利用BP神经网络研究大麦Pn与环境二氧化碳浓度、光照强度、温度和水之间的关系,建立最优BP神经网络模型,并将神经网络的预测值与观测值进行比较,探讨神经网络对大麦Pn预测的实用性。
  1 材料与方法
  2010年11月5日,将大麦(Hordeum vulgare L.)品种矮白青稞种子按照行距15 cm、株距10 cm播种于西华师范大学试验田(北纬30.812°,东经106.067°)。为使植株长势尽可能均一,统一进行水肥管理。
  2011年5月的第1个星期,此时供试材料处于灌浆期。数据测定当天天气晴朗无云,从07:00-19:00,选择5株长势较好且均一的大麦主分蘖植株,利用Li-6400型便携式光合仪测定大麦旗叶的光合日变化,记录的数据主要有:净光合速率(Pn)、光照强度(PARo)、环境二氧化碳浓度(二氧化碳)、气孔导度(Cond)、气温(Tair)、相对湿度(RH)、叶片温度(Tleaf)和蒸腾速率(Trmmol)等。每隔1h测定一次,每株的旗叶重复测定3次,待Pn稳定后保存数据。
  将每片旗叶重复测量3次的数据求平均值作为该植株的光合日变化数据,共得到65个数据。然后将65个数据随机分成2组:第1组包含55个数据,用于BP神经网络训练;第2组包含10个数据,该组数据用于BP神经网络测试。该组的Pn观测值在称为测试值,而神经网络计算输出的Pn称为预测值。BP神经网络模型的训练和预测利用Matlab 6.5进行。其中气温、环境二氧化碳浓度、相对湿度和光照强度作为BP神经网络的输入层,Pn作为输出层。为了评价BP神经网络的准确性,定义了测试值和预测值之间的均方误差(Mean square error,MSE)。
  (1)
  方程(1)中yt和?t分别代表观测值和计算值[5]。为了找出大麦Pn最优的BP神经网络模型参数,首先固定学习速率为0.05,将迭代次数设为1 000、2 000、3 000、4 000进行BP神经网络训练,每个迭代次数进行5次训练,并计算出每次的测试值和测试值的MSE(Mean Square Error)(见表1)。然后为找出最优学习速率,我们将迭代次数设置为最优的迭代次数,而学习速率分别设置为0.05、0.06、0.07进行BP神经网络训练,每个参数进行5次训练,并计算出测试值和预测值的MSE(见表2)。最终将最优参数对应的预测值和测试值作图比较(见图1)。
  2 结果与分析
  表1显示了BP神经网络学习速率为0.05,不同迭代次数对大麦Pn预测值MSE的影响。表1第一列代表不同的4个迭代次数,最后一列代表5次训练所得MSE的平均值。由表1可见:当迭代次数为2 000次时,5次训练所得的平均值最小为1.500。其中当迭代次数为4 000时,第2次训练所得的MSE在所有训练结果中的MSE最小为1.369。
  表2显示了BP神经网络迭代次数为2 000时,不同学习速率下大麦Pn预测值与观测值的MSE。表2第一列代表不同的学习速率,最后一列代表5次训练所得MSE的平均值。由表2可见:当学习速率为0.06时,5次训练所得的MSE平均值最小为1.500。其中当学习速率为0.05时,第4次训练所得的MSE在所有训练结果中的MSE最小为1.314。
  图1显示了利用BP神经网络程序计算大麦Pn的预测值与测试值之间的差异。由图1可见,预测值和测试值之间比较接近,部分测试值和预测值几乎完全重合。
  图1 大麦净光合速率观测值与BP神经网络最优预测值比较
  3 结论与讨论
  净光合速率是评价植物生长情况的重要因素,其受到各种环境因素的影响。以往利用线性模型或偏最小二乘回归模型研究Pn与环境因素的关系表明:Pn与环境因素不是简单的线性关系。本研究利用BP神经网络对大麦的Pn与环境因素中的环境二氧化碳浓度,光照强度、温度和水进行拟合和预测,结果表明BP神经网络在迭代次数为2 000次(见表1),学习速率为0.06时得到的BP神经网络模型是大麦净光合速率最优、最稳定的模型(见表2)。其中第2次训练得到的神经网络其MSE最小为1.368(见表2)。由图1可见,该网络预测的净光合速率预测值与实际测试值比较接近,部分测试值与预测值几乎完全重合。这说明BP神经网络在预测大麦的净光合速率方面具有较高的准确性,这与以往的研究结果一致[5]。本研究表明,BP神经网络可以广泛地用于预测植物的净光合速率。
  参考文献
  [1]Blackman FF. Optima and limiting factors. Annals of Botany, 1905(19):281-295.
  [2]程明,李志强,姜闯道,等.青稞的光合特性及光破坏防御机制[J].作物学报,2008,34(10):1805?1811.
  [3]于智恒,寇立娟,王钢钢.农田水位及环境因素对小麦生理指标的影响预测[J].安徽农业科学,2010,38(34):19252-19253.
  [4]Li Ting, Ji Yuhan, Zhang Man, Sha Sha, Li Minzan: Comparison of Photosynthesis Prediction Methods with BPNN and PLSR in Different Growth Stages of Tomato[J].农业工程学报,2015(31):222-229.
  [5]Chen ZY, Peng ZS, Yang J, et al. A Mathematical Model for Describing Light-response Curves in Nicotiana tabacum L[J]. Photosynthetica, 2011,49(3):467-471.
  (责任编辑:刘昀)
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